有双屿港、台门港、南兆港、苍洞湾、田岙湾5处．均在六横东南部和西北部沿岸，位置适中，离渔场，大陆近，港口水深少淤，风浪小，出口多，航道畅道．避风、锚泊条件良好，可建深水泊位，大有开发价值。

双屿港：是一个优良商港，水深在10～70米，港长8000米，宽在500～1800米之间，是理想的深水良港，港口宽阔，港底平坦．可通航15～20万吨巨轮．离大陆只半小时航程，是国内南来北往船只的主要航线之一。早在十六世纪（明朝嘉靖年间），这个港曾是葡萄牙等外人经营的一个海上商场，今后亦有作为商港的开发价值。

台门港：位于六横岛东端．是舟山渔场南翼主要渔业港口，是六横主要出海通道。处于沈家门港与象山港间中心地段。港长的5公里，宽约 0.5～l公里．水深 5～20米，面积约3.5平方公里。地理位置优越，水域开阔 具备建设大型渔港条件．是六横地区近期开发重点港口，已初具规模，有浮式固定码头16座，其中1000吨级货运码头，500吨级客运码头各一座。台门已形成新型集镇，镇上有上海渔轮厂、台门联营厂、普陀液压件厂等20余家大型企业，公路通大横全岛，经海上轮渡，联通大陆公路网，至 1992年已建成200余亩养殖基地、台门港已定为国家一级渔业港口。

南兆港：位于六横东南端介六横与砚瓦山、笔架山、大蚊虫山之间。南北向，长约6.5公里，宽约3.5公里，锚地面积约10平方公里。水深3.7-7米，大部泥底质，规则半日潮。可避6-7级西和西北风。

苍洞湾：六横东南部大平岗山咀与螺丝山咀间。西、北、东三面环山，南北向，长方形，长约1.5公里，宽约1公里，面积约1平方公里。水深0.4-5.4米，可避东北风，南风时风浪较大。未经开发，只供当地渔船停泊。
田岙湾：六横岛东南部螺丝山咀与老鹰山咀间。东、西、北三面环山，南北向。长约2.5公里，宽约0.8-1公里，面积2.25平方公里。水深0.4-5米，可避东北、西北风。未经开发。只供当地渔船停泊。